Sau khi tách rời thành hai quốc gia độc lập ( 01/01/1993), Cộng hòa Séc và Cộng hòa Xlô-va-kia kế thừa các quan hệ của Liên bang Tiệp Khắc cũ với Việt Nam. Quan hệ giữa Việt Nam với Séc phát triển tích cực.

+ Về chính trị :

- Hai bên đã trao đổi nhiều đòan cấp cao : như các chuyến thăm của Thủ tướng Võ Văn Kiệt ( 1997), Chủ tịch Quốc hội Nông Đức Mạnh ( 1995), Phó Thủ tướng Trần Đức Lương ( 1994), Phó Thủ tướng kiêm Bộ trưởng Bộ Ngoại giao Nguyễn Mạnh Cầm ( 1998), Thủ tướng Chính phủ Nguyễn Tấn Dũng tháng 9/2007, Chủ tịch Quốc hội Nguyễn Phú Trọng tháng 4/2009.

- Về phía Bạn, Chủ tịch Quốc hội M. Uhde và Ngoại trưởng Séc J. Zieleniec ( 4/1994), Thủ tướng Séc Miloš Zeman ( 12/1999), Phó Thủ tướng kiêm Bộ trưởng Ngoại giao Cyril Svoboda (3/2003), Chủ tịch Hạ viện Séc L. Zaoralek ( 2/2006), Tổng thống Václav Klaus( 10/2006)* Bộ trưởng Tài chính Vlastmil Tlusty ( 11/2006), Phó Chủ tịch Hạ viện Vojtěch Filip( 4/2007), Thủ tướng Chính phủ Mirek Topolánek ( 3/2008 ).

+ Về kinh tế - thương mại: Hai bên đã ký Nghị định thư về thừa kế các Điều ước ký trước đây giữa Việt Nam và Tiệp Khắc và một số Hiệp định tạo khung pháp lý cho sự hợp tác trong giai đoạn mới: Hiệp định tránh đánh thuế hai lần, Hiệp định khuyến khích và bảo hộ đầu tư, Hiệp định vận tải hàng không. Ủy ban liên Chính phủ về hợp tác kinh tế-thương mại được thành lập năm 1998( năm 2001 đã họp khóa thứ 3 tại tp Hồ Chí Minh). Hai bên đã ký Hiệp định hợp tác kinh tế ( 13/9/2005) sau khi thỏa thuận chấm dứt hiệu lực Hiệp định thương mại song phương từ tháng 5/2004 khi Séc gia nhập EU. Hai bên cũng đang đàm phán thống nhất bổ sung, sửa đổi Hiệp định Khuyến khích và bảo hộ đầu tư giữa hai nước Việt Nam và Cộng hòa Séc.

Kim ngạch mậu dịch tăng khá nhanh ( năm 1997 đạt 41,6 triệu USD, 1998 48,7 triệu USD, 2001: 65 triệu USD, năm 2002: hơn 67 triệu USD, năm 2003: 70 triệu USD, 2004: khoảng 75 triệu USD, 2005: trên 100 triệu USD, năm 2006: trên 130 triệu USD, năm 2007: khoảng 250 triệu USD, năm 2008: gần 294 triệu USD, năm 2009: gần 300 triệu USD.

Việt Nam xuất sang Cộng hòa Séc chủ yếu nông sản, thực phẩm, sản phẩm may mặc, giày dép, cà phê và các đồ dùng gia đình khác…

Cộng hòa Séc xuất sang Việt Nam chủ yếu là các máy móc, thiết bị y tế, sản phẩm từ sữa, đồ thủy tinh pha lê, thuốc chữa bệnh …

+ Về hợp tác và đầu tư:

Tới nay Séc đầu tư vào Việt Nam khoảng 35 triệu USD cho các dự án về thủy tinh pha lê, bia, thiết bị điện, cao lanh, vật liệu xây dựng. Trong chuyến thăm Séc của Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng vào tháng 9/2007, các doanh nghiệp hai nước đã ký được nhiều thỏa thuận hợp tác có giá trị hàng tỷ USD, đặc biệt là dự án xây dựng nhà máy nhiệt điện Trà Vinh trị giá 3 tỷ USD.

Séc thường xuyên tham gia các Hội nghị quốc tế tài trợ cho Việt Nam và cấp cho ta viện trợ phát triển ODA, tới nay khảng 18 triệu USD: năm 1994 cấp 14 triệu USD hỗ trợ đào tạo về việc làm cho lao động Việt Nam ở Séc về nước, năm 1995 cấp 1,7 triệu USD để xây dựng Trung tâm chỉnh hình cho trẻ em tàn tật ở Bắc Thái( đi vào hoạt động từ 5/1999), tiếp tục trợ giúp hiện đại hóa Bệnh viện Việt – Tiệp tại Hải Phòng ( 800 ngàn USD), Trung tâm đào tạo kỹ thuật giày da ở Hải Phòng ( 700 ngàn USD). Năm 2003, Chính phủ Séc cấp cho Việt Nam viện trợ phát triển không hòan lại trị giá 700.000 USD thực hiện dự án chế biến phân vi sinh tại Hải Dương. Năm 2006, Séc cam kết cấp 1,2 triệu USD ODA, tập trung vào các lĩnh vực bảo vệ môi trường, nông nghiệp, lao động, hiện đại hóa các cơ sở hạ tầng công nghiệp. Năm 2006, thông qua EU Séc đã cam kết cấp 200.000 USD cho Việt Nam để hỗ trợ công tác chống dịch cúm gia cầm. Năm 2007, Séc cam kết viện trợ cho Việt Nam 2,1 triệu USD vào các lĩnh vực về y tế và môi trường.

Chinh phủ Séc đã nhiều lần viện trợ nhân đạo giúp cho các địa phương ở Việt Nam bị thên tai( 1997-2006). Trong thời gian Tổng thống Klaus thăm Việt Nam, Séc đã quyết định ủng hộ 100.000 USD vùng miền Trung bị bão.

Tháng 8/2002 Séc bị trận lụt “ thế kỷ“ gây thiệt hại lớn cho thủ đô Praha và nhiều vùng khác, cộng đồng và doanh nghiệp Việt Nam ở Séc đã tổ chức quyên góp, trợ giúp cho nhân dân bạn với tổng số tiền và hàng lên tới trên 100.000 USD.

Trên diễn đàn quốc tế, Cộng hòa Séc và Việt Nam đã ủng hộ lẫn nhau ứng cử vào ghế thành viên không thường trực của Hội đồng bảo an liên hợp quốc khóa 2008-2009.

+ Về giáo dục, đào tạo: Nếu tính từ những năm 50 của thế kỷ trước cho đến nay, Tiệp Khắc cũ và CH Séc ngày nay đã giúp Việt Nam đào tạo hàng nghìn kỹ sư, bác sỹ, và nghiên cứu sinh có trình độ trên đại học cũng như hàng nghìn học sinh học nghề, thực tập sinh, công nhân kỹ thuật có tay nghề cao… Cho đến nay, chính phủ Séc tiếp tục cấp học bổng cho sinh viên và nghiên cứu sinh của ta ( từ năm 1999 mỗi năm cấp 4-5 học bổng). Hiện nay, hai bên đang đàm phán để ký Hiệp định hợp tác giáo dục-đào tạo.

+ Về cộng đồng ta ở Séc: Hiện tại có khoảng 61.000 công dân Việt Nam sinh sống tại Cộng hòa Séc. Nhìn chung, công dân Việt Nam được đối xử bình đẳng như đối với những người nước ngoài khác. Phía Séc đánh giá tốt cộng đồng Việt Nam, hai bên chú ý tăng cường phối hợp xử lý các vấn đề nảy sinh trong cư trú và làm ăn của bà con cộng đồng tại CH Séc.

Quan hệ giữa hai nhà nước:

Quan hệ giữa hai nhà nước Việt Nam và Tiệp Khắc trước đây và CH Séc ngày nay đã có truyền thống từ lâu đời. Về chính thức chúng ta có thể tính từ ngày hai nước thiết lập quan hệ Ngoại giao 2/2/1950.

Một sự kiện trọng đại là Chủ tịch Hồ Chí Minh đã dẫn đầu Đòan đại biểu Đảng và Chính phủ Việt Nam sang thăm Tiệp Khắc từ ngày 17 đến ngày 20/7/1957. Chuyến thăm này đã mở ra bước ngoặt mới của tình đòan kết, hữu nghị giữa hai dân tộc và nhân dân hại nước Việt Nam và Tiệp Khắc.

Một số các công trình kinh tế, văn hóa, xã hội tiêu biểu mà Tiệp Khắc trước đây và CH Séc ngày nay đã xây dựng giúp đỡ Việt Nam :

- Tại Hải Phòng: Bệnh viện hữu nghị Việt – Tiệp , Cung Văn hóa hữu nghị Viêt-Tiệp, xí nghiệp giày da và trường đạo tạo công nhân kỹ thuật nghề da giày

- Nhà máy bi-khóa Đông Anh,

- Trung tâm phục hồi chức năng trẻ tàn tật tại Thái Nguyên…

- Ngoài ra Tiệp Khắc còn cử các chuyên gia là kỹ sư, cán bộ kỹ thuật sang giúp Việt Nam…

- Gần đây nhất là nhà máy sản xuất phân vi sinh Hải Dương , nguồn viện trợ của Chính phủ Séc.